研究院设立学术委员会，规划和指导学术研究、学科建设、人才培养、对外交流和智库咨询工作。

研究院设立院务委员会，由院长、副院长等构成，全面实施研究院各项工作。

研究院的基层单位为巴尔干研究中心、文明区划研究中心、文化研究院。

       

         研究院的职能部门和研究部门如下：